Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP107P57740 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP107P57740 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP107P57740 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP107P57740 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP107P57740 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP107P57740 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP107P57740 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP107P57740 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP107P57740 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP107P57740 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP107P57740 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP107P57740 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP107P57740 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP107P57740 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP107P57740 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP107P57740 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP107P57740 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP107P57740 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP107P57740 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP107P57740 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP107P57740 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP107P57740 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP107P57740 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP107P57740 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP107P57740 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP107P57740 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP107P57740 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP107P57740 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP107P57740 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP107P57740 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP107P57740 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP107P57740 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP107P57740 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP107P57740 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP107P57740 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP107P57740 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP107P57740 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP107P57740 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP107P57740 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP107P57740 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP107P57740 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP107P57740 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP107P57740 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP107P57740 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP107P57740 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP107P57740 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP107P57740 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP107P57740 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP107P57740 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP107P57740 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP107P57740 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP107P57740 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP107P57740 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP107P57740 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP107P57740 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP107P57740 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP107P57740 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP107P57740 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP107P57740 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP107P57740 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP107P57740 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP107P57740 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP107P57740 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP107P57740 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP107P57740 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP107P57740 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP107P57740 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP107P57740 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP107P57740 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP107P57740 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP107P57740 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP107P57740 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP107P57740 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP107P57740 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP107P57740 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP107P57740 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP107P57740 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP107P57740 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP107P57740 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP107P57740 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP107P57740 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP107P57740 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP107P57740 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP107P57740 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP107P57740 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP107P57740 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP107P57740 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP107P57740 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP107P57740 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP107P57740 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP107P57740 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP107P57740 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP107P57740 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP107P57740 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP107P57740 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP107P57740 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP107P57740 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP107P57740 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP107P57740 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms