Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP3M2P53677 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3M2P53677 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP3M2P53677 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms