Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRCA2P51587 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRCA2P51587 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms