Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMD8P48556 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMD8P48556 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms