Protein–RNA interactions for Protein: P31645

SLC6A4, Sodium-dependent serotonin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4P31645 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A4P31645 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A4P31645 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A4P31645 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms