Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DUSP1P28562 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DUSP1P28562 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DUSP1P28562 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DUSP1P28562 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DUSP1P28562 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DUSP1P28562 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DUSP1P28562 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
DUSP1P28562 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DUSP1P28562 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DUSP1P28562 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DUSP1P28562 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms