Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACO1P21399 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACO1P21399 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACO1P21399 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACO1P21399 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACO1P21399 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACO1P21399 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACO1P21399 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ACO1P21399 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACO1P21399 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACO1P21399 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACO1P21399 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACO1P21399 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACO1P21399 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACO1P21399 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ACO1P21399 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACO1P21399 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACO1P21399 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACO1P21399 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACO1P21399 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACO1P21399 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACO1P21399 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACO1P21399 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ACO1P21399 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACO1P21399 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACO1P21399 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACO1P21399 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACO1P21399 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACO1P21399 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACO1P21399 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACO1P21399 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACO1P21399 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACO1P21399 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACO1P21399 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACO1P21399 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACO1P21399 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACO1P21399 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ACO1P21399 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACO1P21399 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACO1P21399 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACO1P21399 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACO1P21399 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACO1P21399 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACO1P21399 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACO1P21399 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ACO1P21399 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACO1P21399 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACO1P21399 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACO1P21399 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACO1P21399 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACO1P21399 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACO1P21399 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACO1P21399 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACO1P21399 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACO1P21399 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACO1P21399 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACO1P21399 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACO1P21399 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACO1P21399 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACO1P21399 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACO1P21399 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ACO1P21399 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACO1P21399 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACO1P21399 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACO1P21399 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACO1P21399 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ACO1P21399 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACO1P21399 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACO1P21399 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACO1P21399 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACO1P21399 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACO1P21399 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACO1P21399 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACO1P21399 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACO1P21399 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACO1P21399 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACO1P21399 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACO1P21399 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACO1P21399 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACO1P21399 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ACO1P21399 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACO1P21399 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ACO1P21399 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACO1P21399 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ACO1P21399 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACO1P21399 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACO1P21399 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACO1P21399 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACO1P21399 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACO1P21399 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACO1P21399 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACO1P21399 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACO1P21399 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACO1P21399 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACO1P21399 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACO1P21399 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACO1P21399 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACO1P21399 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACO1P21399 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACO1P21399 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms