Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNAP12004 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNAP12004 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNAP12004 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNAP12004 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNAP12004 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNAP12004 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNAP12004 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNAP12004 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNAP12004 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNAP12004 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNAP12004 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNAP12004 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNAP12004 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNAP12004 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCNAP12004 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCNAP12004 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNAP12004 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNAP12004 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNAP12004 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNAP12004 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNAP12004 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNAP12004 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNAP12004 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNAP12004 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNAP12004 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNAP12004 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNAP12004 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNAP12004 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNAP12004 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNAP12004 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNAP12004 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNAP12004 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNAP12004 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNAP12004 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNAP12004 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNAP12004 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNAP12004 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNAP12004 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNAP12004 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCNAP12004 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCNAP12004 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCNAP12004 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCNAP12004 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCNAP12004 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCNAP12004 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCNAP12004 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCNAP12004 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCNAP12004 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCNAP12004 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCNAP12004 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCNAP12004 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCNAP12004 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCNAP12004 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCNAP12004 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCNAP12004 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCNAP12004 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCNAP12004 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCNAP12004 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCNAP12004 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCNAP12004 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCNAP12004 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PCNAP12004 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCNAP12004 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCNAP12004 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCNAP12004 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCNAP12004 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCNAP12004 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCNAP12004 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCNAP12004 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCNAP12004 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCNAP12004 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCNAP12004 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCNAP12004 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCNAP12004 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCNAP12004 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCNAP12004 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCNAP12004 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCNAP12004 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCNAP12004 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCNAP12004 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCNAP12004 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCNAP12004 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCNAP12004 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCNAP12004 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCNAP12004 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCNAP12004 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCNAP12004 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCNAP12004 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCNAP12004 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCNAP12004 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCNAP12004 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCNAP12004 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCNAP12004 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCNAP12004 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCNAP12004 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCNAP12004 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCNAP12004 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCNAP12004 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCNAP12004 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms