Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPM3P06753 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPM3P06753 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPM3P06753 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPM3P06753 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPM3P06753 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPM3P06753 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPM3P06753 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPM3P06753 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPM3P06753 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPM3P06753 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPM3P06753 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPM3P06753 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPM3P06753 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPM3P06753 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPM3P06753 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPM3P06753 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TPM3P06753 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPM3P06753 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPM3P06753 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPM3P06753 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPM3P06753 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPM3P06753 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPM3P06753 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPM3P06753 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPM3P06753 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPM3P06753 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPM3P06753 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TPM3P06753 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TPM3P06753 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TPM3P06753 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TPM3P06753 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TPM3P06753 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TPM3P06753 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TPM3P06753 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TPM3P06753 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TPM3P06753 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TPM3P06753 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM3P06753 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM3P06753 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM3P06753 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM3P06753 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM3P06753 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM3P06753 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPM3P06753 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPM3P06753 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPM3P06753 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPM3P06753 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPM3P06753 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPM3P06753 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPM3P06753 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPM3P06753 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPM3P06753 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPM3P06753 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPM3P06753 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TPM3P06753 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPM3P06753 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPM3P06753 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPM3P06753 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPM3P06753 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM3P06753 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM3P06753 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM3P06753 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM3P06753 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM3P06753 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM3P06753 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM3P06753 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM3P06753 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM3P06753 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM3P06753 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM3P06753 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM3P06753 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM3P06753 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPM3P06753 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPM3P06753 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPM3P06753 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPM3P06753 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPM3P06753 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPM3P06753 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPM3P06753 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPM3P06753 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPM3P06753 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPM3P06753 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPM3P06753 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPM3P06753 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPM3P06753 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPM3P06753 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPM3P06753 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPM3P06753 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPM3P06753 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TPM3P06753 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPM3P06753 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TPM3P06753 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPM3P06753 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPM3P06753 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPM3P06753 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPM3P06753 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPM3P06753 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPM3P06753 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPM3P06753 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms