Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HLA-DOAP06340 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HLA-DOAP06340 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HLA-DOAP06340 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms