Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NPHP4O75161 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NPHP4O75161 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NPHP4O75161 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NPHP4O75161 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NPHP4O75161 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
NPHP4O75161 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NPHP4O75161 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NPHP4O75161 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NPHP4O75161 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NPHP4O75161 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NPHP4O75161 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
NPHP4O75161 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC33.78■■■■□ 3
NPHP4O75161 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
NPHP4O75161 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NPHP4O75161 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NPHP4O75161 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NPHP4O75161 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NPHP4O75161 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
NPHP4O75161 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NPHP4O75161 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
NPHP4O75161 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
NPHP4O75161 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NPHP4O75161 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NPHP4O75161 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NPHP4O75161 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NPHP4O75161 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NPHP4O75161 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NPHP4O75161 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NPHP4O75161 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
NPHP4O75161 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NPHP4O75161 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NPHP4O75161 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NPHP4O75161 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NPHP4O75161 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NPHP4O75161 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NPHP4O75161 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NPHP4O75161 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
NPHP4O75161 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
NPHP4O75161 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
NPHP4O75161 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
NPHP4O75161 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
NPHP4O75161 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NPHP4O75161 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NPHP4O75161 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NPHP4O75161 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NPHP4O75161 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
NPHP4O75161 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NPHP4O75161 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NPHP4O75161 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NPHP4O75161 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NPHP4O75161 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
NPHP4O75161 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NPHP4O75161 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NPHP4O75161 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NPHP4O75161 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NPHP4O75161 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NPHP4O75161 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NPHP4O75161 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NPHP4O75161 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NPHP4O75161 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NPHP4O75161 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NPHP4O75161 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NPHP4O75161 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NPHP4O75161 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
NPHP4O75161 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms