Protein–RNA interactions for Protein: O60687

SRPX2, Sushi repeat-containing protein SRPX2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPX2O60687 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPX2O60687 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms