Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PFDN6O15212 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms