Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IKBKBO14920 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IKBKBO14920 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
IKBKBO14920 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IKBKBO14920 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IKBKBO14920 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IKBKBO14920 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IKBKBO14920 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IKBKBO14920 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IKBKBO14920 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IKBKBO14920 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IKBKBO14920 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IKBKBO14920 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IKBKBO14920 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
IKBKBO14920 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IKBKBO14920 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IKBKBO14920 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IKBKBO14920 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IKBKBO14920 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
IKBKBO14920 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
IKBKBO14920 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IKBKBO14920 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms