Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFIT3O14879 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IFIT3O14879 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFIT3O14879 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
IFIT3O14879 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
IFIT3O14879 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFIT3O14879 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
IFIT3O14879 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.56■■■□□ 2
IFIT3O14879 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFIT3O14879 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.55■■■□□ 2
IFIT3O14879 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFIT3O14879 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFIT3O14879 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFIT3O14879 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.55■■■□□ 2
IFIT3O14879 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
IFIT3O14879 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFIT3O14879 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFIT3O14879 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFIT3O14879 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFIT3O14879 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
IFIT3O14879 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
IFIT3O14879 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
IFIT3O14879 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IFIT3O14879 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IFIT3O14879 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFIT3O14879 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFIT3O14879 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IFIT3O14879 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.52■■■□□ 2
IFIT3O14879 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFIT3O14879 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFIT3O14879 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
IFIT3O14879 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms