Protein–RNA interactions for Protein: O00750

PIK3C2B, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2BO00750 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PIK3C2BO00750 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PIK3C2BO00750 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PIK3C2BO00750 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PIK3C2BO00750 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PIK3C2BO00750 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PIK3C2BO00750 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PIK3C2BO00750 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PIK3C2BO00750 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
PIK3C2BO00750 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PIK3C2BO00750 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PIK3C2BO00750 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PIK3C2BO00750 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PIK3C2BO00750 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PIK3C2BO00750 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PIK3C2BO00750 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PIK3C2BO00750 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PIK3C2BO00750 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PIK3C2BO00750 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PIK3C2BO00750 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PIK3C2BO00750 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PIK3C2BO00750 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PIK3C2BO00750 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PIK3C2BO00750 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PIK3C2BO00750 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PIK3C2BO00750 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PIK3C2BO00750 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
PIK3C2BO00750 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
PIK3C2BO00750 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PIK3C2BO00750 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PIK3C2BO00750 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PIK3C2BO00750 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PIK3C2BO00750 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PIK3C2BO00750 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
PIK3C2BO00750 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PIK3C2BO00750 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PIK3C2BO00750 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PIK3C2BO00750 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PIK3C2BO00750 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PIK3C2BO00750 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
PIK3C2BO00750 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PIK3C2BO00750 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PIK3C2BO00750 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PIK3C2BO00750 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PIK3C2BO00750 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
PIK3C2BO00750 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PIK3C2BO00750 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PIK3C2BO00750 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PIK3C2BO00750 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PIK3C2BO00750 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PIK3C2BO00750 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PIK3C2BO00750 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PIK3C2BO00750 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PIK3C2BO00750 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PIK3C2BO00750 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PIK3C2BO00750 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PIK3C2BO00750 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PIK3C2BO00750 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PIK3C2BO00750 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PIK3C2BO00750 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PIK3C2BO00750 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PIK3C2BO00750 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PIK3C2BO00750 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PIK3C2BO00750 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PIK3C2BO00750 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PIK3C2BO00750 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PIK3C2BO00750 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PIK3C2BO00750 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PIK3C2BO00750 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PIK3C2BO00750 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PIK3C2BO00750 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms