Protein–RNA interactions for Protein: O00232

PSMD12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD12O00232 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD12O00232 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD12O00232 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD12O00232 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMD12O00232 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD12O00232 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD12O00232 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD12O00232 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD12O00232 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD12O00232 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD12O00232 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD12O00232 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD12O00232 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMD12O00232 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD12O00232 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMD12O00232 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms