Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms