Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PATL2C9JE40 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PATL2C9JE40 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 353.7 ms