Protein–RNA interactions for Protein: A8MPY1

GABRR3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR3A8MPY1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRR3A8MPY1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRR3A8MPY1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms