Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP73A6NFT4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 300.8 ms