Protein–RNA interactions for Protein: P61978

HNRNPK, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPKP61978 BCAM-209ENST00000590624 991 ntTSL 1 (best)20■□□□□ 0.794e-25■■■■■ 53.1
HNRNPKP61978 LAMA5-202ENST00000370677 1674 ntTSL 219.3■□□□□ 0.686e-10■■■■■ 53
HNRNPKP61978 LAMA5-213ENST00000497053 723 ntTSL 314.43□□□□□ -0.16e-10■■■■■ 53
HNRNPKP61978 PI4KB-207ENST00000446339 566 ntTSL 316.53■□□□□ 0.241e-11■■■■■ 52.9
HNRNPKP61978 PI4KB-208ENST00000455060 934 ntTSL 214.32□□□□□ -0.121e-11■■■■■ 52.9
HNRNPKP61978 PI4KB-212ENST00000489889 880 ntTSL 212.88□□□□□ -0.351e-11■■■■■ 52.9
HNRNPKP61978 ARHGEF1-215ENST00000598444 425 ntTSL 28.98□□□□□ -0.972e-13■■■■■ 51.8
HNRNPKP61978 NF1-219ENST00000579081 8788 ntTSL 1 (best)4.97□□□□□ -1.611e-14■■■■■ 51.7
HNRNPKP61978 SRPK2-211ENST00000482862 329 ntTSL 521.5■■□□□ 1.034e-14■■■■■ 51.7
HNRNPKP61978 SRPK2-212ENST00000482897 715 ntTSL 521.38■■□□□ 1.014e-14■■■■■ 51.7
HNRNPKP61978 SRPK2-206ENST00000465112 568 ntTSL 314.53□□□□□ -0.084e-14■■■■■ 51.7
HNRNPKP61978 SRPK2-203ENST00000460391 666 ntTSL 213.92□□□□□ -0.184e-14■■■■■ 51.7
HNRNPKP61978 SRPK2-204ENST00000462282 505 ntTSL 312.39□□□□□ -0.434e-14■■■■■ 51.7
HNRNPKP61978 SRPK2-202ENST00000393651 3650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.984e-14■■■■■ 51.7
HNRNPKP61978 AL662899.3-203ENST00000409691 1903 ntTSL 313.86□□□□□ -0.195e-8■■■■■ 51.7
HNRNPKP61978 AL662899.3-201ENST00000375880 2487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.745e-8■■■■■ 51.7
HNRNPKP61978 LY6G5B-207ENST00000375864 2654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.755e-8■■■■■ 51.7
HNRNPKP61978 ARID1B-225ENST00000637532 445 ntTSL 511.22□□□□□ -0.612e-11■■■■■ 51.6
HNRNPKP61978 ARID1B-218ENST00000636748 8853 ntTSL 28.64□□□□□ -1.032e-11■■■■■ 51.6
HNRNPKP61978 DROSHA-207ENST00000507438 860 ntTSL 49.78□□□□□ -0.846e-17■■■■■ 51.5
HNRNPKP61978 DROSHA-201ENST00000344624 5102 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.96e-17■■■■■ 51.5
HNRNPKP61978 DROSHA-202ENST00000442743 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.936e-17■■■■■ 51.5
HNRNPKP61978 DROSHA-220ENST00000513349 4681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.16e-17■■■■■ 51.5
HNRNPKP61978 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.516e-17■■■■■ 51.5
HNRNPKP61978 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.324e-61■■■■■ 51.2
HNRNPKP61978 LINC01341-204ENST00000505748 595 ntTSL 4 BASIC9.66□□□□□ -0.864e-61■■■■■ 51.2
HNRNPKP61978 PDLIM7-204ENST00000393546 671 ntTSL 318.96■□□□□ 0.631e-7■■■■■ 51.2
HNRNPKP61978 CTDNEP1-209ENST00000574205 1506 ntTSL 532.87■■■□□ 2.853e-48■■■■■ 50.4
HNRNPKP61978 CTDNEP1-206ENST00000571409 741 ntTSL 530.62■■■□□ 2.493e-48■■■■■ 50.4
HNRNPKP61978 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.033e-48■■■■■ 50.4
HNRNPKP61978 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.93e-48■■■■■ 50.4
HNRNPKP61978 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.883e-48■■■■■ 50.4
HNRNPKP61978 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.453e-48■■■■■ 50.4
HNRNPKP61978 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.453e-48■■■■■ 50.4
HNRNPKP61978 CTDNEP1-211ENST00000575783 876 ntTSL 516.75■□□□□ 0.273e-48■■■■■ 50.4
HNRNPKP61978 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.078e-27■■■■■ 50.2
HNRNPKP61978 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.092e-16■■■■■ 49.9
HNRNPKP61978 ADCY7-210ENST00000567277 2304 ntTSL 1 (best)13.91□□□□□ -0.182e-16■■■■■ 49.9
HNRNPKP61978 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.372e-16■■■■■ 49.9
HNRNPKP61978 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.432e-16■■■■■ 49.9
HNRNPKP61978 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.442e-16■■■■■ 49.9
HNRNPKP61978 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.023e-7■■■■■ 49.7
HNRNPKP61978 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.117e-7■■■■■ 49.4
HNRNPKP61978 TEAD4-204ENST00000443986 641 ntTSL 313.03□□□□□ -0.325e-11■■■■■ 49.4
HNRNPKP61978 ARID1B-235ENST00000638000 1401 ntTSL 57.93□□□□□ -1.144e-8■■■■■ 49.1
HNRNPKP61978 ARHGEF1-211ENST00000595723 872 ntTSL 515.75■□□□□ 0.112e-13■■■■■ 48.8
HNRNPKP61978 GRAMD4-205ENST00000447351 375 ntTSL 313.74□□□□□ -0.214e-14■■■■■ 48.8
HNRNPKP61978 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.294e-14■■■■■ 48.8
HNRNPKP61978 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.54e-14■■■■■ 48.8
HNRNPKP61978 GRAMD4-207ENST00000490378 193 ntTSL 32.64□□□□□ -1.994e-14■■■■■ 48.8
HNRNPKP61978 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.161e-13■■■■■ 48.5
HNRNPKP61978 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.591e-13■■■■■ 48.5
HNRNPKP61978 SLC22A18-207ENST00000463571 1030 ntTSL 518.36■□□□□ 0.531e-13■■■■■ 48.5
HNRNPKP61978 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.431e-13■■■■■ 48.5
HNRNPKP61978 SLC22A18-205ENST00000449603 682 ntTSL 317.38■□□□□ 0.371e-13■■■■■ 48.5
HNRNPKP61978 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.271e-13■■■■■ 48.5
HNRNPKP61978 SLC22A18-204ENST00000441077 831 ntTSL 515.07■□□□□ 01e-13■■■■■ 48.5
HNRNPKP61978 SLC22A18-212ENST00000498209 782 ntTSL 314.3□□□□□ -0.121e-13■■■■■ 48.5
HNRNPKP61978 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.412e-25■■■■■ 48.5
HNRNPKP61978 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.482e-25■■■■■ 48.5
HNRNPKP61978 MLXIPL-209ENST00000467221 774 ntTSL 510.82□□□□□ -0.685e-27■■■■■ 48.2
HNRNPKP61978 MOV10-214ENST00000490413 1370 ntTSL 215.03■□□□□ -01e-14■■■■■ 48.2
HNRNPKP61978 MOV10-207ENST00000471160 493 ntTSL 311.66□□□□□ -0.541e-14■■■■■ 48.2
HNRNPKP61978 MOV10-204ENST00000413052 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.581e-14■■■■■ 48.2
HNRNPKP61978 MOV10-203ENST00000369645 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.741e-14■■■■■ 48.2
HNRNPKP61978 MOV10-213ENST00000488160 896 ntTSL 210.37□□□□□ -0.751e-14■■■■■ 48.2
HNRNPKP61978 MOV10-202ENST00000369644 4100 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.981e-14■■■■■ 48.2
HNRNPKP61978 MOV10-201ENST00000357443 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.981e-14■■■■■ 48.2
HNRNPKP61978 MOV10-206ENST00000468624 4689 ntTSL 58.48□□□□□ -1.051e-14■■■■■ 48.2
HNRNPKP61978 MOV10-217ENST00000496577 4312 ntTSL 28.4□□□□□ -1.061e-14■■■■■ 48.2
HNRNPKP61978 MOV10-210ENST00000481711 379 ntTSL 36.34□□□□□ -1.391e-14■■■■■ 48.2
HNRNPKP61978 EGFL7-207ENST00000492862 723 ntTSL 518.28■□□□□ 0.524e-7■■■■■ 48.1
HNRNPKP61978 OGFOD3-203ENST00000577495 872 ntTSL 321.17■□□□□ 0.982e-8■■■■■ 48
HNRNPKP61978 OGFOD3-204ENST00000577606 598 ntTSL 419.96■□□□□ 0.792e-8■■■■■ 48
HNRNPKP61978 EGFL7-205ENST00000490469 456 ntTSL 517.12■□□□□ 0.333e-7■■■■■ 47.8
HNRNPKP61978 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.671e-12■■■■■ 47.5
HNRNPKP61978 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.241e-12■■■■■ 47.5
HNRNPKP61978 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.151e-12■■■■■ 47.5
HNRNPKP61978 PQLC1-213ENST00000591964 856 ntTSL 325.7■■□□□ 1.72e-7■■■■■ 47.2
HNRNPKP61978 PQLC1-208ENST00000494607 666 ntTSL 316.06■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 47.2
HNRNPKP61978 PQLC1-207ENST00000478144 409 ntTSL 311.85□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 47.2
HNRNPKP61978 LTBP3-211ENST00000528966 553 ntTSL 418.28■□□□□ 0.522e-40■■■■■ 47.1
HNRNPKP61978 PDIA5-202ENST00000467157 2232 ntTSL 212.04□□□□□ -0.483e-14■■■■■ 47
HNRNPKP61978 PDIA5-203ENST00000469649 722 ntTSL 54.59□□□□□ -1.673e-14■■■■■ 47
HNRNPKP61978 WDR6-214ENST00000488572 610 ntTSL 420.44■□□□□ 0.862e-11■■■■■ 46.9
HNRNPKP61978 WDR6-213ENST00000473238 568 ntTSL 319.26■□□□□ 0.672e-11■■■■■ 46.9
HNRNPKP61978 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.522e-11■■■■■ 46.9
HNRNPKP61978 WDR6-206ENST00000438660 852 ntTSL 518.24■□□□□ 0.512e-11■■■■■ 46.9
HNRNPKP61978 WDR6-205ENST00000429900 563 ntTSL 517.01■□□□□ 0.312e-11■■■■■ 46.9
HNRNPKP61978 WDR6-212ENST00000472878 556 ntTSL 516.82■□□□□ 0.282e-11■■■■■ 46.9
HNRNPKP61978 WDR6-216ENST00000489684 1155 ntTSL 216.38■□□□□ 0.212e-11■■■■■ 46.9
HNRNPKP61978 WDR6-209ENST00000461687 555 ntTSL 415.41■□□□□ 0.062e-11■■■■■ 46.9
HNRNPKP61978 WDR6-210ENST00000462064 589 ntTSL 515.39■□□□□ 0.052e-11■■■■■ 46.9
HNRNPKP61978 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.032e-11■■■■■ 46.9
HNRNPKP61978 WDR6-215ENST00000489427 564 ntTSL 414.28□□□□□ -0.122e-11■■■■■ 46.9
HNRNPKP61978 WDR6-217ENST00000491365 491 ntTSL 313.17□□□□□ -0.32e-11■■■■■ 46.9
HNRNPKP61978 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.432e-11■■■■■ 46.9
HNRNPKP61978 WDR6-221ENST00000610967 4259 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.512e-11■■■■■ 46.9
HNRNPKP61978 WDR6-211ENST00000471162 3565 ntTSL 1 (best)11.75□□□□□ -0.532e-11■■■■■ 46.9
HNRNPKP61978 WDR6-203ENST00000419837 538 ntTSL 411.14□□□□□ -0.632e-11■■■■■ 46.9
Retrieved 100 of 15,354 protein–RNA pairs in 56.1 ms