Protein–RNA interactions for Protein: P42839

VNX1, Low affinity vacuolar monovalent cation/H(+) antiporter, yeastyeast

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VNX1P42839 OPI9YLR338W 858 nt12.67□□□□□ -0.38
VNX1P42839 SAH1YER043C 1350 nt12.66□□□□□ -0.38
VNX1P42839 TOM20YGR082W 552 nt12.61□□□□□ -0.39
VNX1P42839 GAR1YHR089C 618 nt12.59□□□□□ -0.39
VNX1P42839 YPL071CYPL071C 471 nt12.59□□□□□ -0.39
VNX1P42839 FTR1YER145C 1215 nt12.57□□□□□ -0.4
VNX1P42839 CUS2YNL286W 858 nt12.57□□□□□ -0.4
VNX1P42839 SSA3YBL075C 1950 nt12.56□□□□□ -0.4
VNX1P42839 HMT1YBR034C 1047 nt12.55□□□□□ -0.4
VNX1P42839 POA1YBR022W 534 nt12.53□□□□□ -0.4
VNX1P42839 NEJ1YLR265C 1029 nt12.52□□□□□ -0.41
VNX1P42839 YNL208WYNL208W 600 nt12.49□□□□□ -0.41
VNX1P42839 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.48□□□□□ -0.41
VNX1P42839 RPN10YHR200W 807 nt12.48□□□□□ -0.41
VNX1P42839 MPS2YGL075C 1164 nt12.45□□□□□ -0.42
VNX1P42839 SKI6YGR195W 741 nt12.45□□□□□ -0.42
VNX1P42839 YLR036CYLR036C 612 nt12.44□□□□□ -0.42
VNX1P42839 IDI1YPL117C 867 nt12.43□□□□□ -0.42
VNX1P42839 LSM12YHR121W 564 nt12.42□□□□□ -0.42
VNX1P42839 NUF2YOL069W 1356 nt12.41□□□□□ -0.42
VNX1P42839 SHU1YHL006C 453 nt12.4□□□□□ -0.42
VNX1P42839 ARC19YKL013C 516 nt12.4□□□□□ -0.42
VNX1P42839 YOL150CYOL150C 312 nt12.4□□□□□ -0.42
VNX1P42839 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt12.38□□□□□ -0.43
VNX1P42839 YNL040WYNL040W 1371 nt12.38□□□□□ -0.43
VNX1P42839 UBC12YLR306W 567 nt12.37□□□□□ -0.43
VNX1P42839 RUF21RUF21 707 nt12.32□□□□□ -0.44
VNX1P42839 BI2Q0110 1272 nt12.31□□□□□ -0.44
VNX1P42839 LCP5YER127W 1074 nt12.31□□□□□ -0.44
VNX1P42839 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt12.3□□□□□ -0.44
VNX1P42839 COX3Q0275 810 nt12.3□□□□□ -0.44
VNX1P42839 BSC6YOL137W 1494 nt12.29□□□□□ -0.44
VNX1P42839 YPR1YDR368W 939 nt12.29□□□□□ -0.44
VNX1P42839 YEL074WYEL074W 339 nt12.29□□□□□ -0.44
VNX1P42839 TGS1YPL157W 948 nt12.29□□□□□ -0.44
VNX1P42839 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt12.28□□□□□ -0.44
VNX1P42839 RER1YCL001W 567 nt12.28□□□□□ -0.44
VNX1P42839 ZTA1YBR046C 1005 nt12.27□□□□□ -0.45
VNX1P42839 YGR011WYGR011W 327 nt12.26□□□□□ -0.45
VNX1P42839 YML079WYML079W 606 nt12.26□□□□□ -0.45
VNX1P42839 VPS28YPL065W 729 nt12.26□□□□□ -0.45
VNX1P42839 FIP1YJR093C 984 nt12.25□□□□□ -0.45
VNX1P42839 ARP6YLR085C 1317 nt12.25□□□□□ -0.45
VNX1P42839 PUN1YLR414C 792 nt12.24□□□□□ -0.45
VNX1P42839 YHR054CYHR054C 1065 nt12.22□□□□□ -0.45
VNX1P42839 YJL107CYJL107C 1164 nt12.22□□□□□ -0.45
VNX1P42839 TSR2YLR435W 618 nt12.22□□□□□ -0.45
VNX1P42839 RSA3YLR221C 663 nt12.21□□□□□ -0.45
VNX1P42839 THP3YPR045C 1413 nt12.2□□□□□ -0.46
VNX1P42839 MCT1YOR221C 1083 nt12.2□□□□□ -0.46
VNX1P42839 URH1YDR400W 1023 nt12.19□□□□□ -0.46
VNX1P42839 YJR018WYJR018W 363 nt12.19□□□□□ -0.46
VNX1P42839 TIR1YER011W 765 nt12.18□□□□□ -0.46
VNX1P42839 PTC2YER089C 1395 nt12.18□□□□□ -0.46
VNX1P42839 ECM9YKR004C 1134 nt12.16□□□□□ -0.46
VNX1P42839 YOR139CYOR139C 393 nt12.16□□□□□ -0.46
VNX1P42839 BUD23YCR047C 828 nt12.15□□□□□ -0.46
VNX1P42839 MET8YBR213W 825 nt12.15□□□□□ -0.46
VNX1P42839 SCEIQ0160 708 nt12.13□□□□□ -0.47
VNX1P42839 YMR144WYMR144W 1029 nt12.13□□□□□ -0.47
VNX1P42839 TAZ1YPR140W 1146 nt12.13□□□□□ -0.47
VNX1P42839 SSA1YAL005C 1929 nt12.13□□□□□ -0.47
VNX1P42839 YJR120WYJR120W 351 nt12.1□□□□□ -0.47
VNX1P42839 YLR283WYLR283W 945 nt12.1□□□□□ -0.47
VNX1P42839 SUT2YPR009W 807 nt12.1□□□□□ -0.47
VNX1P42839 RSM23YGL129C 1353 nt12.09□□□□□ -0.47
VNX1P42839 CBS1YDL069C 690 nt12.09□□□□□ -0.47
VNX1P42839 DIA1YMR316W 1011 nt12.09□□□□□ -0.47
VNX1P42839 RAD17YOR368W 1206 nt12.09□□□□□ -0.47
VNX1P42839 SUT1YGL162W 900 nt12.07□□□□□ -0.48
VNX1P42839 YHM2YMR241W 945 nt12.07□□□□□ -0.48
VNX1P42839 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt12.07□□□□□ -0.48
VNX1P42839 YDL157CYDL157C 357 nt12.06□□□□□ -0.48
VNX1P42839 MPC1YGL080W 393 nt12.06□□□□□ -0.48
VNX1P42839 CSI1YMR025W 888 nt12.06□□□□□ -0.48
VNX1P42839 MOD5YOR274W 1287 nt12.06□□□□□ -0.48
VNX1P42839 ERV29YGR284C 933 nt12.04□□□□□ -0.48
VNX1P42839 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.04□□□□□ -0.48
VNX1P42839 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt12.04□□□□□ -0.48
VNX1P42839 CCE1YKL011C 1062 nt12.03□□□□□ -0.48
VNX1P42839 PRM4YPL156C 855 nt12.03□□□□□ -0.48
VNX1P42839 ERG29YMR134W 714 nt12.02□□□□□ -0.49
VNX1P42839 NAB2YGL122C 1578 nt12.01□□□□□ -0.49
VNX1P42839 HMRA1YCR097W 381 nt12□□□□□ -0.49
VNX1P42839 YDL158CYDL158C 309 nt12□□□□□ -0.49
VNX1P42839 CLB6YGR109C 1143 nt12□□□□□ -0.49
VNX1P42839 MSA2YKR077W 1092 nt12□□□□□ -0.49
VNX1P42839 SPT5YML010W 3192 nt12□□□□□ -0.49
VNX1P42839 SRB2YHR041C 633 nt11.99□□□□□ -0.49
VNX1P42839 YLR311CYLR311C 348 nt11.99□□□□□ -0.49
VNX1P42839 ERG12YMR208W 1332 nt11.98□□□□□ -0.49
VNX1P42839 NPL3YDR432W 1245 nt11.98□□□□□ -0.49
VNX1P42839 PCL6YER059W 1263 nt11.98□□□□□ -0.49
VNX1P42839 CHA1YCL064C 1083 nt11.97□□□□□ -0.49
VNX1P42839 YHP1YDR451C 1062 nt11.97□□□□□ -0.49
VNX1P42839 YHR145CYHR145C 357 nt11.96□□□□□ -0.49
VNX1P42839 SED5YLR026C 1023 nt11.96□□□□□ -0.49
VNX1P42839 YMR057CYMR057C 372 nt11.95□□□□□ -0.5
VNX1P42839 DCI1YOR180C 816 nt11.95□□□□□ -0.5
VNX1P42839 YGR168CYGR168C 1131 nt11.93□□□□□ -0.5
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