Protein–RNA interactions for Protein: U3KQA8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQA8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
U3KQA8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
U3KQA8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
U3KQA8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
U3KQA8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U3KQA8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U3KQA8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U3KQA8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U3KQA8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U3KQA8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U3KQA8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
U3KQA8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
U3KQA8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U3KQA8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U3KQA8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U3KQA8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U3KQA8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U3KQA8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
U3KQA8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U3KQA8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U3KQA8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U3KQA8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U3KQA8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U3KQA8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U3KQA8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U3KQA8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U3KQA8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U3KQA8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U3KQA8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U3KQA8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U3KQA8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U3KQA8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U3KQA8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
U3KQA8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
U3KQA8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U3KQA8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U3KQA8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U3KQA8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
U3KQA8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
U3KQA8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
U3KQA8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
U3KQA8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U3KQA8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U3KQA8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U3KQA8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U3KQA8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U3KQA8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U3KQA8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U3KQA8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U3KQA8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
U3KQA8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U3KQA8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
U3KQA8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
U3KQA8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
U3KQA8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U3KQA8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U3KQA8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
U3KQA8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
U3KQA8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
U3KQA8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
U3KQA8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
U3KQA8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
U3KQA8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
U3KQA8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
U3KQA8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
U3KQA8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U3KQA8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U3KQA8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
U3KQA8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
U3KQA8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U3KQA8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
U3KQA8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
U3KQA8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
U3KQA8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U3KQA8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
U3KQA8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
U3KQA8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U3KQA8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U3KQA8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U3KQA8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U3KQA8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U3KQA8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U3KQA8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U3KQA8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U3KQA8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U3KQA8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U3KQA8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U3KQA8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
U3KQA8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U3KQA8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U3KQA8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
U3KQA8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
U3KQA8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U3KQA8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U3KQA8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U3KQA8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U3KQA8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U3KQA8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U3KQA8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U3KQA8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms