Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LYVE1Q9Y5Y7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms