Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP8A1Q9Y2Q0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP8A1Q9Y2Q0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP8A1Q9Y2Q0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms