Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PNMA8BQ9ULN7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNMA8BQ9ULN7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA8BQ9ULN7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms