Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
MBD2Q9UBB5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MBD2Q9UBB5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MBD2Q9UBB5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms