Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHCHD3Q9NX63 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHCHD3Q9NX63 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms