Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KCND1Q9NSA2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCND1Q9NSA2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms