Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG7

SDR39U1, Epimerase family protein SDR39U1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR39U1Q9NRG7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDR39U1Q9NRG7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDR39U1Q9NRG7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SDR39U1Q9NRG7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDR39U1Q9NRG7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDR39U1Q9NRG7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SDR39U1Q9NRG7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDR39U1Q9NRG7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDR39U1Q9NRG7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDR39U1Q9NRG7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDR39U1Q9NRG7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDR39U1Q9NRG7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDR39U1Q9NRG7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDR39U1Q9NRG7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms