Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SARS2Q9NP81 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SARS2Q9NP81 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms