Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC40A1Q9NP59 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC40A1Q9NP59 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms