Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC10

OTOF, Otoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOFQ9HC10 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
OTOFQ9HC10 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
OTOFQ9HC10 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
OTOFQ9HC10 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
OTOFQ9HC10 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
OTOFQ9HC10 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
OTOFQ9HC10 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
OTOFQ9HC10 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
OTOFQ9HC10 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
OTOFQ9HC10 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
OTOFQ9HC10 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
OTOFQ9HC10 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
OTOFQ9HC10 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
OTOFQ9HC10 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
OTOFQ9HC10 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
OTOFQ9HC10 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
OTOFQ9HC10 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
OTOFQ9HC10 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
OTOFQ9HC10 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
OTOFQ9HC10 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
OTOFQ9HC10 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms