Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLRE1BQ9H816 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DCLRE1BQ9H816 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.2 ms