Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSS3Q9H6R3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACSS3Q9H6R3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSS3Q9H6R3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms