Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E7

DEF6, Differentially expressed in FDCP 6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEF6Q9H4E7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DEF6Q9H4E7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DEF6Q9H4E7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DEF6Q9H4E7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DEF6Q9H4E7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DEF6Q9H4E7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DEF6Q9H4E7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DEF6Q9H4E7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DEF6Q9H4E7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DEF6Q9H4E7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DEF6Q9H4E7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DEF6Q9H4E7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DEF6Q9H4E7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DEF6Q9H4E7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DEF6Q9H4E7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DEF6Q9H4E7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DEF6Q9H4E7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DEF6Q9H4E7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DEF6Q9H4E7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DEF6Q9H4E7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DEF6Q9H4E7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DEF6Q9H4E7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DEF6Q9H4E7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DEF6Q9H4E7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DEF6Q9H4E7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DEF6Q9H4E7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DEF6Q9H4E7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DEF6Q9H4E7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DEF6Q9H4E7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DEF6Q9H4E7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DEF6Q9H4E7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DEF6Q9H4E7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DEF6Q9H4E7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DEF6Q9H4E7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DEF6Q9H4E7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DEF6Q9H4E7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DEF6Q9H4E7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DEF6Q9H4E7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DEF6Q9H4E7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DEF6Q9H4E7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DEF6Q9H4E7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DEF6Q9H4E7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DEF6Q9H4E7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DEF6Q9H4E7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DEF6Q9H4E7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DEF6Q9H4E7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DEF6Q9H4E7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DEF6Q9H4E7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DEF6Q9H4E7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.4 ms