Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T2

SEMA6C, Semaphorin-6C, humanhuman

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6CQ9H3T2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA6CQ9H3T2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6CQ9H3T2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms