Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD3

MRPL4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4Q9BYD3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRPL4Q9BYD3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPL4Q9BYD3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms