Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSBP4Q9BWG4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSBP4Q9BWG4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms