Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRZ2

TRIM56, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM56Q9BRZ2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM56Q9BRZ2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM56Q9BRZ2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM56Q9BRZ2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM56Q9BRZ2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM56Q9BRZ2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM56Q9BRZ2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM56Q9BRZ2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM56Q9BRZ2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms