Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
EBF4Q9BQW3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EBF4Q9BQW3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245.3 ms