Protein–RNA interactions for Protein: Q99442

SEC62, Translocation protein SEC62, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC62Q99442 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEC62Q99442 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEC62Q99442 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC62Q99442 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC62Q99442 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC62Q99442 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC62Q99442 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC62Q99442 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC62Q99442 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC62Q99442 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC62Q99442 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC62Q99442 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC62Q99442 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEC62Q99442 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEC62Q99442 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEC62Q99442 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SEC62Q99442 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEC62Q99442 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEC62Q99442 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEC62Q99442 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEC62Q99442 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SEC62Q99442 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SEC62Q99442 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEC62Q99442 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEC62Q99442 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms