Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPRD1AQ96P16 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPRD1AQ96P16 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms