Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEUROD6Q96NK8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEUROD6Q96NK8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD6Q96NK8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.3 ms