Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT4

LINC01600, Uncharacterized protein encoded by LINC01600, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01600Q96MT4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01600Q96MT4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01600Q96MT4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms