Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3IL1Q8TBN0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms