Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEST2Q8NFU1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BEST2Q8NFU1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BEST2Q8NFU1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms