Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAE3

LINC01555, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01555, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01555Q8NAE3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC01555Q8NAE3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC01555Q8NAE3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms