Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D1

PDCD7, Programmed cell death protein 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD7Q8N8D1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCD7Q8N8D1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCD7Q8N8D1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCD7Q8N8D1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCD7Q8N8D1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCD7Q8N8D1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCD7Q8N8D1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCD7Q8N8D1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCD7Q8N8D1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCD7Q8N8D1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCD7Q8N8D1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCD7Q8N8D1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCD7Q8N8D1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCD7Q8N8D1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCD7Q8N8D1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCD7Q8N8D1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCD7Q8N8D1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDCD7Q8N8D1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCD7Q8N8D1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms